Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mfsd13aQ6PDE8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mfsd13aQ6PDE8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms