Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Atl2Q6PA06 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atl2Q6PA06 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms