Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Polr2mQ6P6I6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr2mQ6P6I6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms