Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg16l2Q6KAU8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg16l2Q6KAU8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg16l2Q6KAU8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg16l2Q6KAU8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg16l2Q6KAU8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms