Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ParpbpQ6IRT3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ParpbpQ6IRT3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms