Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fgd6Q69ZL1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fgd6Q69ZL1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Fgd6Q69ZL1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Fgd6Q69ZL1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fgd6Q69ZL1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fgd6Q69ZL1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms