Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cntn4Q69Z26 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms