Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Top2bQ64511 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Top2bQ64511 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Top2bQ64511 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms