Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vat1Q62465 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vat1Q62465 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms