Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox19Q62249 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox19Q62249 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox19Q62249 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox19Q62249 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms