Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpcQ62241 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms