Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms