Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc5a6Q5U4D8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc5a6Q5U4D8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms