Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Scaf1Q5U4C3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scaf1Q5U4C3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Scaf1Q5U4C3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf1Q5U4C3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms