Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Brip1Q5SXJ3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brip1Q5SXJ3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brip1Q5SXJ3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.8 ms