Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r195Q5SVD6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r195Q5SVD6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms