Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I9

Trav2, T cell receptor alpha variable 2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav2Q5R1I9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trav2Q5R1I9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav2Q5R1I9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms