Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp13Q5BKP2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp13Q5BKP2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms