Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
4933416C03RikQ3V063 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933416C03RikQ3V063 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms