Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E330034G19RikQ3UWX6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E330034G19RikQ3UWX6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms