Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm12888Q3UW77 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm12888Q3UW77 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm12888Q3UW77 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm12888Q3UW77 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm12888Q3UW77 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm12888Q3UW77 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm12888Q3UW77 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm12888Q3UW77 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm12888Q3UW77 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm12888Q3UW77 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm12888Q3UW77 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm12888Q3UW77 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm12888Q3UW77 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm12888Q3UW77 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm12888Q3UW77 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm12888Q3UW77 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm12888Q3UW77 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm12888Q3UW77 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms