Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr1d1Q3UV55 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr1d1Q3UV55 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms