Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlrc4Q3UP44 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlrc4Q3UP44 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms