Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef3Q3UGY8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef3Q3UGY8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms