Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Carmil3Q3UFQ8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Carmil3Q3UFQ8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Carmil3Q3UFQ8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms