Protein–RNA interactions for Protein: Q3UCV8

Otulin, Ubiquitin thioesterase otulin, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtulinQ3UCV8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OtulinQ3UCV8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OtulinQ3UCV8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OtulinQ3UCV8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OtulinQ3UCV8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OtulinQ3UCV8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OtulinQ3UCV8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OtulinQ3UCV8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OtulinQ3UCV8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OtulinQ3UCV8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OtulinQ3UCV8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtulinQ3UCV8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtulinQ3UCV8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtulinQ3UCV8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtulinQ3UCV8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtulinQ3UCV8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtulinQ3UCV8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtulinQ3UCV8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtulinQ3UCV8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtulinQ3UCV8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtulinQ3UCV8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtulinQ3UCV8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
OtulinQ3UCV8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OtulinQ3UCV8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OtulinQ3UCV8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OtulinQ3UCV8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OtulinQ3UCV8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OtulinQ3UCV8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms