Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trip13Q3UA06 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip13Q3UA06 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms