Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LbrQ3U9G9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LbrQ3U9G9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms