Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtpbp6Q3U6U5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtpbp6Q3U6U5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms