Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Palb2Q3U0P1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Palb2Q3U0P1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Palb2Q3U0P1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms