Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc9Q3U0M1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc9Q3U0M1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms