Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc69Q3TCJ8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc69Q3TCJ8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms