Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cul4aQ3TCH7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul4aQ3TCH7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cul4aQ3TCH7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
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