Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG0

Rhox4d, Reproductive homeobox 4D, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4dQ2MDG0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox4dQ2MDG0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox4dQ2MDG0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox4dQ2MDG0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox4dQ2MDG0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox4dQ2MDG0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox4dQ2MDG0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox4dQ2MDG0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox4dQ2MDG0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox4dQ2MDG0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox4dQ2MDG0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox4dQ2MDG0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox4dQ2MDG0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms