Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Edem3Q2HXL6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Edem3Q2HXL6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms