Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpusd3Q14AI6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rpusd3Q14AI6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd3Q14AI6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms