Protein–RNA interactions for Protein: Q149F5

Tmem71, Transmembrane protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem71Q149F5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmem71Q149F5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem71Q149F5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem71Q149F5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem71Q149F5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem71Q149F5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem71Q149F5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem71Q149F5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem71Q149F5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem71Q149F5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem71Q149F5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem71Q149F5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem71Q149F5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem71Q149F5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem71Q149F5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem71Q149F5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem71Q149F5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem71Q149F5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms