Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem52bQ0VBF2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem52bQ0VBF2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem52bQ0VBF2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms