Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CbfbQ08024 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CbfbQ08024 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CbfbQ08024 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms