Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ebf1Q07802 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ebf1Q07802 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ebf1Q07802 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ebf1Q07802 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ebf1Q07802 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ebf1Q07802 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ebf1Q07802 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ebf1Q07802 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ebf1Q07802 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ebf1Q07802 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ebf1Q07802 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ebf1Q07802 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms