Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Aplp2Q06335 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aplp2Q06335 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aplp2Q06335 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms