Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sox13Q04891 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sox13Q04891 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sox13Q04891 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms