Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RelbQ04863 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelbQ04863 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RelbQ04863 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms