Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gjb2Q00977 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb2Q00977 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjb2Q00977 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms