Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
F8a1Q00558 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
F8a1Q00558 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
F8a1Q00558 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms