Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cds1P98191 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cds1P98191 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cds1P98191 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cds1P98191 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cds1P98191 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cds1P98191 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cds1P98191 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cds1P98191 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cds1P98191 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms