Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rbbp6P97868 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rbbp6P97868 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbbp6P97868 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms