Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gfra1P97785 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gfra1P97785 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms