Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkp1P97350 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkp1P97350 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms