Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vgll3P85442 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vgll3P85442 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms